Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtpraP18052 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PtpraP18052 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PtpraP18052 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpraP18052 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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PtpraP18052 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms