Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp53P15975 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms