Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rag1P15919 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rag1P15919 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rag1P15919 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms