Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptbP15508 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SptbP15508 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SptbP15508 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SptbP15508 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SptbP15508 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SptbP15508 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SptbP15508 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SptbP15508 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SptbP15508 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SptbP15508 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SptbP15508 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SptbP15508 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SptbP15508 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SptbP15508 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SptbP15508 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SptbP15508 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptbP15508 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptbP15508 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptbP15508 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptbP15508 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptbP15508 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptbP15508 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptbP15508 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptbP15508 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptbP15508 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptbP15508 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptbP15508 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SptbP15508 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SptbP15508 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SptbP15508 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SptbP15508 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SptbP15508 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SptbP15508 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SptbP15508 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SptbP15508 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SptbP15508 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SptbP15508 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SptbP15508 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SptbP15508 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms