Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd44P15379 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd44P15379 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd44P15379 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd44P15379 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd44P15379 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms