Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q9P14431 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q9P14431 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms