Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms