Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cxcl2P10889 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cxcl2P10889 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms