Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms