Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P10404 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P10404 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P10404 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P10404 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P10404 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P10404 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P10404 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P10404 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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