Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a2P08122 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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