Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnfP06804 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnfP06804 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnfP06804 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnfP06804 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TnfP06804 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TnfP06804 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnfP06804 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnfP06804 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnfP06804 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnfP06804 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms