Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms