Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-AaP01910 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-AaP01910 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-AaP01910 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-AaP01910 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms