Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01652 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01652 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01652 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01652 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01652 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01652 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01652 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01652 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01652 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01652 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01652 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01652 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01652 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01652 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01652 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01652 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01652 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01652 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01652 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01652 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01652 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01652 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01652 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01652 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01652 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01652 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01652 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01652 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01652 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01652 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01652 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01652 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01652 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01652 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01652 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01652 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01652 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01652 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01652 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01652 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01652 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01652 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01652 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01652 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01652 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01652 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01652 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01652 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms