Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01641 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01641 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01641 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01641 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01641 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01641 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01641 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01641 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
P01641 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
P01641 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01641 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01641 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01641 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
P01641 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01641 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01641 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01641 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01641 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01641 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01641 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01641 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01641 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
P01641 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01641 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01641 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01641 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms