Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01638 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01638 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01638 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01638 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01638 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01638 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01638 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01638 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01638 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01638 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01638 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01638 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01638 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01638 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01638 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01638 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01638 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P01638 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P01638 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01638 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01638 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01638 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01638 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01638 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01638 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01638 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01638 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01638 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms