Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apaf1O88879 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms