Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JtbO88824 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JtbO88824 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JtbO88824 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JtbO88824 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JtbO88824 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JtbO88824 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JtbO88824 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JtbO88824 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms