Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tom1O88746 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1O88746 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tom1O88746 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms