Protein–RNA interactions for Protein: O88627

Slc28a2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a2O88627 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms