Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmx1bO88609 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms