Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms