Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vti1bO88384 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms