Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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