Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms