Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DffbO54788 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DffbO54788 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DffbO54788 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DffbO54788 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DffbO54788 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DffbO54788 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffbO54788 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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