Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Srpk2O54781 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srpk2O54781 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms