Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek2O35942 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek2O35942 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nek2O35942 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek2O35942 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek2O35942 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms