Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5r2O35926 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms