Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NudcO35685 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NudcO35685 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NudcO35685 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NudcO35685 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NudcO35685 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NudcO35685 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NudcO35685 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NudcO35685 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NudcO35685 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NudcO35685 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NudcO35685 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NudcO35685 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NudcO35685 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NudcO35685 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NudcO35685 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NudcO35685 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NudcO35685 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NudcO35685 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NudcO35685 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NudcO35685 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NudcO35685 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NudcO35685 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NudcO35685 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NudcO35685 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NudcO35685 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NudcO35685 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NudcO35685 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NudcO35685 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NudcO35685 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NudcO35685 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NudcO35685 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NudcO35685 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NudcO35685 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NudcO35685 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NudcO35685 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms