Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edil3O35474 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms