Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Atf6bO35451 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Atf6bO35451 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Atf6bO35451 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Atf6bO35451 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Atf6bO35451 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf6bO35451 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Atf6bO35451 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Atf6bO35451 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf6bO35451 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf6bO35451 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Atf6bO35451 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf6bO35451 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf6bO35451 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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