Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Abcc1O35379 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms