Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Srsf5O35326 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms