Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2O35245 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms