Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe40O35185 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms