Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sypl1O09117 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms