Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EllO08856 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EllO08856 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EllO08856 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EllO08856 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EllO08856 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EllO08856 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EllO08856 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EllO08856 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EllO08856 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EllO08856 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EllO08856 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EllO08856 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EllO08856 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EllO08856 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EllO08856 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EllO08856 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EllO08856 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EllO08856 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EllO08856 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EllO08856 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms