Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2035J3QP87 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2035J3QP87 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms