Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm21797J3QNW5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm21797J3QNW5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm21797J3QNW5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm21797J3QNW5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm21797J3QNW5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm21797J3QNW5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Gm21797J3QNW5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21797J3QNW5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21797J3QNW5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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