Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3336J3QMQ6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms