Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930544D05RikJ3QK56 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms