Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp6G5E8P0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp6G5E8P0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp6G5E8P0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms