Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms