Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ercc6F8VPZ5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ercc6F8VPZ5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms