Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms