Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8220F6YKI2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms