Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pagr1bF6V0H0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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