Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17555F6U8B9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17555F6U8B9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms